1.安装bbrcd /usr/src && wget -N --no-check-certificate "https://raw.githubusercontent.com/chiakge/Linux-NetSpeed/master/tcp.sh" && chmod +x tcp.sh && ./tcp.sh
2.Wget命令安装
CentOS系统:yum install wget -y
Debian/Ubuntu系统:apt-get install -y wget
3.Curl命令安装
ubuntu/debian 系统安装:apt-get update -y && apt-get install curl -y
centos 系统安装 Curl 方法:yum update -y && yum install curl -y
4.检查某端口是否开启firewall-cmd --query-port=25/tcp --zone=public #查询25端口是否开启,自行修改端口号
返回no即未开启,显示yes为已开启。firewall-cmd --query-port=80/tcp --zone=publicfirewall-cmd --query-port=888/tcp --zone=publicfirewall-cmd --query-port=8888/tcp --zone=publicfirewall-cmd --query-port=443/tcp --zone=publicfirewall-cmd --query-port=20/tcp --zone=publicfirewall-cmd --query-port=21/tcp --zone=public
开启某端口代码firewall-cmd --zone=public --add-port=25/tcp --permanent #添加25端口,如需添加其他端口,自行修改端口号
修改完成后需要重启服务器才能生效5.查看防火墙状态CentOS系统:systemctl status firewalld
有如下提示(running)表示开启Active: active (running)关闭防火墙systemctl stop firewalld
有如下提示表示已经关闭Active: inactive (dead)开启防火墙,没有任何提示即开启成功systemctl start firewalld
再次查看防火墙状态systemctl status firewalld
有如下提示(running)表示开启Active: active (running)Debian/Ubuntu系统:iptables -P INPUT ACCEPTiptables -P FORWARD ACCEPTiptables -P OUTPUT ACCEPTiptables -Fapt-get purge netfilter-persistentreboot
Linux文本操作常用命令
在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令:
通过多敲键盘,形成手感 肌肉记忆 ,熟练掌握这些命令,在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍(主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记)
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来:
参数的用法介绍:
注意事项:
用 cat 命令可以 查看文本 ,也可以 编辑文本 ,编辑文本要加 > 符号,退出时,另起一行,按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件,tac逆向查看
结合 管道符|使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行,默认 10 行 (在R语言里head和tail默认是前6行)。
less命令用得最多 ,more命令用得比较少
3.1 less命令
less[参数]文件名
less命令重要的补充用法1 :
需要注意 退出 :只要使用less命令, 按q键
less命令重要的补充用法2 :
参数用法:
less命令 不加参数 查看文件:
less命令加 -N参数 查看文件:显示行号
less命令加 -S参数 查看文件:单行显示,非常规整
对比:less和cat命令显示文本行号的用法:less -N,cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐页查看,按空格翻页,按回车换行 ,more命令一般很少用,熟练掌握less命令就好
查看压缩文件
wc 统计字符是也把换行符统计进去,但是别的命令不一定会把换行符算进去,。
常见参数:
切记:用less命令,按q退出
cut命令是按关键词来切的
常见参数:
排列前:
排列后:
解释:1和0比,1大;7和0比,7大…在sort字典排序里,100816比1737小,所以100816排在前面。
命令行查看一个表格结构时,因为制表符对齐的原因,出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样,所以 加上-n参数 , 让数值有数学意义上的大小来排序 。
uniq命令去重,只有两行出现重复,而且是相邻的两行,如果不相邻,即使出现两行一模一样,不会去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
换其它文件试试
总之,uniq命令使用时经常和sort一起
常见参数:
常见用法1:
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常见用法2 : paste - -
常见参数:
要养成一个好习惯,原始数据不要轻易修改,修改的东西另外保存,文本保存用> (重定向)或是>>(追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ,然后管道符传递给 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容
3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列
4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计
5. 在第4步的基础上,将空格替换成制表符
补充小知识 :
清屏 :controlL
查看历史(输入过的)命令 :history