1、细心检查菌枝和菌棒。杂菌喜欢生长在腐生环境中，所以制作培育菌棒时，应该选择未腐朽、无霉菌的新鲜木材，同时要尽可能的缩短培养时间，一旦发现菌棒上出现杂菌，要立即清除，并置于阳光下暴晒1-2天，如果杂菌较多的情况要及时废弃。
2、麻种消毒。在接种前要细心检查麻种，如果发现有霉菌感染细心，首先是刮除日晒，或用75%酒精、多菌灵等局部消毒后使用，如果发现有损伤或者霉烂的麻种一旦要及时废弃。
3、加强管理。在填充时一定要填实，切不可留有空隙，同时要加强温度、湿度以及空气的管理，控制好穴内的湿度，保持环境干燥，这样尽可能的减少杂菌产生。
4、天麻穴不宜过大、过深。利用菌棒数量较少的菌麻栽培、是防止杂菌感染的一种最好的栽培方法。
5、加大蜜环菌的用量。菌枝或菌种放得多，菌生长长得快，就能抑制其他杂菌生长，也是一种不错的防治方法。
天麻杂菌是很常见的病菌，如何防治天麻杂菌？
培养菌材时要细心检查菌枝和菌棒，如果发现菌棒上有杂菌，轻者刮掉，晒1~2日；重者废弃。检查所用麻种，如发现感染霉菌，轻者刮去、日晒，或用75%酒精、多菌灵等局部消毒后使用。凡碰伤、霉烂的麻种都要废弃。填充物要填实，切不可留有空隙。加强温、湿、气的管理，控制穴内湿度，保持干燥环境，就可以减少霉菌发生。天麻穴不宜过大、过深。利用菌棒数量较少的菌麻栽培、是防止杂菌感染的一种最好的栽培方法。加大蜜环菌的用量，菌枝或菌种放得多，菌长得快，就能抑制其他杂菌生长。
1.仔细检查菌枝和菌棒。杂菌喜欢在腐生的环境中生长，所以在制作栽培棒时，要选择未腐朽、无霉菌的新鲜木材，同时要尽可能缩短栽培时间。一旦发现棒上有杂菌，应立即去除，并在阳光下暴晒1-2天。如果杂菌多，要及时丢弃。
2.大麻种子的消毒。接种前，仔细检查大麻种子。如果仔细发现霉菌感染，先刮掉太阳，或用75%酒精和多菌灵局部消毒后使用。如发现有破损或发霉的火麻仁，应及时丢弃。
3.填充物要填满，不能有空隙。加强温湿度和空气的管理，控制洞内湿度，保持环境干燥，可以减少霉菌的发生。
4.天马穴不宜过大过深。使用菌麻配少量菌棒是防止杂菌感染的最佳栽培方法。
5.增加蜜环菌的用量。树枝或菌种放得越多，细菌生长越快，可以抑制其他杂菌的生长。
天麻无根和无绿叶，滋养器官退化，是靠蜜环菌提供营养，和蜜环菌过着特殊的生活关系。这种生活关系的建立，是从天麻被蜜环菌当做寄主、菌丝与天麻块茎接触时开始的。
天麻杂菌很常见，如何防治天麻杂菌？
这种菌确实比较常见，但也是菌类比较多的，所以想要防治这一种，主要还是采取综合防治的措施。之所以要采用综合防治，主要是因为这种病它含的病菌不是一种，而是多种病菌会呈现出不同的伤害，所以在防控起来就不能够使用一种方法，而是多管齐下。在防治这种病菌的时候，尽量避免菌种之间的交叉感染，要不然防治起来就会更麻烦。
引发这种病菌的大多都是因为土壤的湿度过大，不能够及时的排水，容易形成积水。特别是在种植天麻的时候，有一些地势较低的形成了积水，又有一些树叶浸泡在里面，容易导致腐败细菌寄生，这样就会容易引发天麻杂菌。在预防这个疾病的时候，一定要严格控制好这个土壤的湿度，如果过于干旱，浇水的时候一定要适度均匀就行。
种植的时候一定要选择优良品种，这样可以很好的抑制其他杂菌的生长。选择优良品种，自然抵抗力更强，生长力更强，从而能够起到很好的抑制杂菌生长的作用，对于菌种一定要选择纯种的优质的纯菌种会省掉很多的麻烦。
段木的选择一定要新鲜一点，不要一些老旧的，同时在使用之前一定要经过阳光暴晒。阳光暴晒可以很好的杀灭一些细菌和病毒，抑制一些杂菌的生长。如果没有经过阳光暴晒，那么会出现一些污染比较重的，对于一些污染较重的段木就不应该要使用了，以免给后续带来麻烦。
最后就是这个填充料和培养料一定要经过消毒并且晾晒好，避免有一些缝隙，如果有缝隙很有可能会滋生一些杂菌。这个功夫一定要做到细，不能够马虎，也不能够大意以为没关系，往往是因为疏忽，所以才给我们带来了影响。
天麻栽培后如何防治病害？
危害天麻及其细菌物质的真菌主要有三种。首先，该真菌主要包括半知菌亚科的黄单胞菌和氯霉素菌，主要污染细菌物质，危害天麻。它们以片状或斑点形式分布在细菌材料或天麻表面，有的粘稠，有真菌气味，影响蜜环菌和天麻的正常生长，易引起天麻腐烂，严重影响产量。腐生细菌，主要由半菌丝亚科的镰刀菌组成。菌丝首先侵染天麻，在天麻块茎上产生黑斑和黑斑，最后引起块茎腐烂，导致产量和品质显著下降。担子菌亚科以蜜环菌为主的杂菌。菌丝和菌丝与蜜环菌相似，但菌丝在细菌表面呈扇形，不发出荧光。这种杂菌能抑制蜜环菌的生长，使天麻无营养死亡。
防治措施。选择排水通风良好的地形和土壤进行耕作。由于杂菌大多生活在腐生生活中，蜜环菌也能寄生在活菌棒上，因此在培养菌料时，应选择无公害的菌枝和菌棒，并进行扦插培养；同时，每个孔内培养的细菌数量不易过多，一般控制在150个左右；如果木棒或树枝已感染霉菌和其他杂菌，刮去阳光，或用0.1%高锰酸钾溶液消毒，或用1%石灰水浸泡12小时左右，严重者丢弃。种植天麻时，应选择纯净优良的蜜环菌种类，适当增加接种量，创造蜜环菌的生长优势，抑制杂菌生长；同时，注意培养物的填充，不留缝隙，避免杂菌滋生。加强温、湿、气管理，破坏杂菌生长环境，减少杂菌数量，严防孔内积水。大力推广天麻有性生殖技术，提高天麻的抗逆性。
天麻与蜜环菌之间存在着共生营养关系，天麻生长所需水量小于蜜环菌生长所需水量。土壤含水量大时，适宜蜜环菌生长，不适宜天麻生长，既能增强蜜环菌的生长优势，抑制天麻生长，又能打破蜜环菌正常的生理侵染，既侵染母麻，又侵染新天麻，侵入天麻块茎中柱层，造成天麻溃疡；同时，在不利于天麻生长的条件下，蜜环菌也能通过营养茎从母麻侵入新麻。新麻腐烂后，体内充满蜜环菌，强菌索附着在天麻块茎表皮层，可分泌一些化学物质，使天麻表皮层溃烂变黑，严重影响产量和品质。
栽培宜选用排水通风良好的腐殖土和砂壤土，种子麻宜选用有性生殖的白麻和稻麻，以提高天麻的生长势和抗逆性。种植时应注意设置排水沟，特别是连续暴雨后，当种植穴有积水时，应及时清除积水。在深秋和初冬季节，除了排除积水外，还应经常进行穴位检查。天麻被蜜环菌为害时，应提前采收。
