1、地理位置不同,珠海站位于中国广东省珠海市香洲区拱北街道昌盛路5号,明珠站位于中国广东省珠海市明珠北路。站台规模不同,珠海站站场规模为5台8线,明珠站的站场规模为2台2线。

2、途经线路不同,珠海站途经线路为广珠城际铁路和珠机城际铁路,明珠站途经线路为广珠城际铁路。

3、珠海站,为广珠城际铁路、珠机城际铁路的起止站点,是珠海重要的客运枢纽站。明珠站,为广珠城际铁路的中间站。

4、珠海站始建于2009年,于2020年8月19日珠机城际铁路珠海站完工,明珠站于2009年始建,于2012年12月31日正式开通运营。