基因突变结果一定产生等位基因。原因如下：

1、当基因突变出现新基因后，由于它位于一条单链上，在与它碱基配对的另一条单链上有另外一个基因，即等位基因；

2、当新基因与突起物形式存在时，它在复制产生子链时，同样又因碱基配对性，在新子链上添出另一个基因，即一对等位基因；

3、由于碱基配对规律的必然性，单链DNA上的基因，碱基配对后另一链上的相同位点又出现的基因，是突变基因的等位基因。

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