《梅花档案》剧情讲述的是建国初期一个国民党特务组织秘藏在重庆,公安战士潜入该组织进行卧底,经过斗智斗勇的较量后,终于一举破获了该特务组织的故事。

建国之初,古老的中华大地一派喜气,然而欢愉的背后仍有冰冷的暗流涌动。在四川省渝州,曾经称霸一时的土匪头子白敬斋被人民政府正法,而他曾居住过的老宅闹鬼的传闻则越传越凶。龙飞十一名来自北京的青年,他在渝州当地档案馆做文员,而档案馆的宿舍正是征用自白敬斋的老宅。由于所有人都怕鬼,因此龙飞只得一个人住进宿舍,却接连遭遇多起奇怪灵异的事件。不久,档案馆发生一起命案,刑警队长肖克由此入驻档案馆调查。在这一过程中,肖克和龙飞不仅感知到自己身上的异样,更偶然知晓了一个名为梅花党的特务组织的秘密…… 

该剧刻意的营造反而使人对某些情节感到莫名其妙。尤其是开篇部分,刻意去制造诡异的效果,不把观众吓坏不罢休。这样的场景一次两次可以,多了只能让人感到幼稚。过多的悬疑导致剧情的拖沓,让情节发展得缓慢,让人看得心急。