《火影忍者》鸣人vs佩恩天道是第383集到第388集。鸣人在察觉到情况有异后,便与深作一同赶回木叶。但出现在他眼前的,竟是已被破坏殆尽的木叶忍者村。纲手也为了保护村民的性命,用尽了所有的查克拉。于是鸣人强忍住愤怒与悲痛,奋不顾身地与培因展开一场激烈的对战!
为替自来也报仇,他决定接受深作大人的提议,前往自来也曾修行的妙木山,作艰苦的仙术”训练。经过一番修行,鸣人总算是基本掌握了自然力量,深作将自来也的遗作——《坚毅忍传》交给鸣人。鸣人在九尾怂恿下准备揭开封印之时,四代封印的查克拉现身阻止,鸣人才得知自己的身世,四代与鸣人交谈后重新封印九尾,并消失。
鸣人脱离地爆天星的束缚,打败天道,并用逆向探查找到佩恩本体——长门。与鸣人的交谈中,长门被鸣人感化。放弃原定计划,决定将梦想托付给鸣人,期盼鸣人能够完成几代人的使命,之后因施展外道·轮回天生之术复活卡卡西、静音、深作等所有死者而耗尽生命。鸣人送走小南,回到木叶。