维吾尔族有许多禁忌，这些禁忌伴随着他们信仰的宗教及长期的生活习惯而沿袭下来。在吃的方面，他们不吃未经念经宰杀的牲畜，不吃自死的牲畜，不吃未放血的牲畜，另外还不吃猪、狗、驴、骡等家畜和禽类。在南疆的部分维吾尔族还禁食马肉。同时，对任何吃的东西不允许用脚踩，见到馕、饼干等食物掉在地上，要拣起来放在不易被人踩到的地方;洗碗涮锅水不能倒在人们走路的地方，而要倒在墙旮旯或不易被人踩到的地方。
在服饰方面，禁止穿袒胸露背和短小的衣服，最反感穿裤衩背心在室外活动和作客。
院落的大门禁朝西开，因为伊斯兰教的圣地在西边。但因地形所限，在无可奈何的情况下，也可例外。
在睡觉的时候，禁忌头朝东脚朝西，或四肢平伸直仰。在屋内对坐的姿式也有要求，一般要求跪坐 ( 炕上或地毯上 ) ，禁忌双脚伸直，脚底朝人。接受礼物或接茶碗时，要双手接，单手接被认为是不礼貌的行为。
吃饭时不能随便拨弄盘中的食物，挑来拣去;不能随便到锅灶前面，不要剩食在碗中，如不慎将饭屑或馕渣弄到地上，要拣起来放在近前的餐布上，不要将抓起的饭粒再放在共用的饭盘之中;吃饭或与交谈时，禁止吐痰、擤鼻涕、打哈欠、放屁等。吃完饭，长者在领做祝祷时，禁忌东张西望或起立。
抽麻烟 ( 吸毒 ) 、赌钱、偷盗、酗酒、斗殴、说谎都被视为丑恶行为，受到舆论的谴责。
在麻扎 ( 墓地 ) 和清真寺内，以及涝坝、水源和伙房等地，禁忌大小便、随地吐痰和携带脏的东西。
晚辈不得在长辈面前吸烟、喝酒，口吐粗鲁、龌龊的语言。见了长辈要起立、让坐，并施礼问候。
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