在历史上，瑶族人民在预防医学方面也总结出丰富的经验。如瑶族先民很早就认识到某些疾病是可以互相传染的，当隔离了病人或焚烧其尸或迁徙其居，就能预防某种疾病的传播。《开建县志》：瑶族“惧患痘，有出而染者，不得复入”。在《阮通志》中有这样的记载：“有病殁，则并焚其尸徙居焉”。瑶族对天花等烈性传染病，“采取严禁天花患者回归原来材寨居住的方法，将病人与居民隔离开，以减少这种疾病的流行”。
瑶族的村规民约，也反映了瑶族预防医学历史的又一个侧面。如《瑶家河规》中规定：“不能乱倒杂物污染河水”。瑶族的“石牌”中也有关于不得乱放药毒鱼的规定。这都说明了瑶族人民在与疾病作斗争中很早就认识到疾病可以传染，用隔离或消灭传染源的方法可以制止传染病的流行，用预防的方法可以减少疾病的发生，并采取了简单易行而有效的隔离方法及地方法规性的环境保护措施。瑶族人民就是将防与治紧密地结合起来，从而保证了本民族的健康、繁衍，也为人类的健康作出了贡献。
瑶医用的植物药，常与动物的肉、骨头或内脏配伍。究其原因是：植物药大多是用新鲜的原生药，未经过特殊的加工炮制，一般水煎服或外洗，这样药力一般较猛，易过量而产生毒副作用，特别是打类药，与动物性药物配伍后，药力就和缓些。再则配入骨头等共炖，煎煮的时间较长，一些毒性植物药，久煎后毒性可降低。
同时，由于瑶族历来生活条件艰苦，生活水准较低，动物蛋白来源少，加入动物的骨、肉、内脏共炖，吃肉喝汤，可以增加机体动物蛋白的摄取量，从而增加机体的抵抗力，有些动、植物药配用，还能起到协同、增加药效的作用。由于上述种种原因，瑶族用药以动、植药物配伍，常能收到殊效。
卫生习俗，它反映了瑶族人民灿烂的传统文化的健康部分，成为瑶族医药重要内容之一。
瑶族大多高山为居，迁徙频繁，游耕生产，生活条件十分艰苦，但深山老林，药物资源却十分丰富。勇敢勤劳的瑶族人民，利用本地的药物资源防病治病、保护健康、繁衍后代的经验是很丰富的。
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